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cell reports 微量细胞染色质构象捕获技术及其在小鼠造血谱系中的应用

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染色质构象捕获(Chromatin Conformation Capture, 3C)技术是研究基因组三维空间结构的重要工具,其衍生技术使得在单细胞或微量细胞水平解析染色质高级结构成为可能。近年来,微量细胞染色质构象捕获技术(如single-cell Hi-C、DNase Hi-C、Low-input Hi-C等)在细胞技术研发领域取得显著进展。这些技术通过优化细胞裂解、酶切、连接和建库步骤,实现在数百至数千个细胞中高效捕获染色质相互作用,突破了传统技术需要大量细胞的限制。

在小鼠造血谱系研究中,微量细胞染色质构象捕获技术展现出独特价值。造血系统包含多能干细胞、祖细胞及各类成熟血细胞,其分化过程伴随染色质结构的动态重组。通过该技术,研究人员能够:1)揭示造血干细胞向红系、髓系、淋系分化过程中拓扑相关结构域(TADs)和染色质环的重新配置;2)发现关键转录因子(如GATA1、PU.1)在三维基因组架构调控中的作用机制;3)解析造血异常疾病(如白血病)中染色质空间组织的病理改变。

实际应用中,该技术结合小鼠模型和细胞分选技术,实现了对稀有造血祖细胞(如LT-HSC、MPP)的特异性分析。例如,通过比较正常与突变型小鼠的造血细胞,研究人员发现了与造血分化相关的增强子-启动子互作网络,为理解造血发育的表观遗传调控提供了新视角。

尽管微量细胞染色质构象捕获技术仍面临信噪比低、数据复杂性高等挑战,但其在解析细胞异质性、追踪发育动态过程中的优势日益凸显。随着单细胞多组学技术的整合与计算方法的发展,该技术有望在造血谱系研究及其他生命科学领域发挥更大作用,推动细胞技术研发迈向新的高度。

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更新时间:2025-11-29 21:06:22